当DNA模板数量减少而扩增循环次数增加的时候，杂合子不平衡也增加了r，但当循环次数增加而模板上海亲子鉴定DNA数量减少的时候，在所有位点上Stutter尖峰的数量和尺寸也都增加了。当样本被过度扩增的时候，这种做法显著地增加了被观测stutter的数量和尺寸。在第28个循环且DNA浓度低于100pg的时候，SGM和SGM+都不能产生等位基因。然而当上海亲子鉴定DNA浓度低于25 -50pg （相当于7 -14个模板）的时候，我们还是可以在第34个循环上获得完整的基因图谱。如果DNA模板数量低于这个水平，那么等位基因的遗失现象就会发生。这可能是因为在这种水平下的可用的上海亲子鉴定DNA模板中没有完整的遗传补码。当被分析的DNA浓度少于100pg的时候，分析时使用34个以上的循环次数并没有什么优势，这是因为人为产物的存在增加了，并且基因图谱也变得越来越不平衡。因此，当上海亲子鉴定DNA的数量少于100pg的时候，主观上而言，被评估的最好的折中（根据Whi-taker等854）是使用34个扩增循环获得的。
