述两种拆分方式可以不发生交互重组（拆分i），也可发生交互重组（拆分ii）。从Holliday结构拆分方式可以看出，对于异源双链区内的基因或遗传标记，不论拆分以何种方式进行，在这些部位都发生了遗传学变化。
非姐妹染色体之间的交换过程中，上海亲子鉴定双方的地位是平等的，但交换的DNA的数量不一定相等，称作不等交换( unequal crossing over)。在DNA片段长度多态性座位，同源染色体的两小卫星序列间出现不等数目的重复单位交换重组，便形成新的片段长度等位基因。．
重组多发生在上海亲子鉴定DNA分子某些特定的区域，人类小卫星序列富含G/C，常成簇分布在染色体易发生重组的亚端粒区。同时，这类非编码区的小卫星序列几乎不受选择的压力，在物种进化过程中，小卫星的高度遗传变异的特征，在减轻编码区选择压力，维持物种的遗传稳定上具有重要意义。经过不断地重组，不等交换DNA的不断地积祟，可以在小卫星基因座产生新的片段长度等位基因，构成极其复杂的VNTR基因座。 ，
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