来自上海亲子鉴定样本内部及环境的一些物质，如血红蛋白，泥土成分，多聚糖，纺织染料等，可通过降低样本DNA提取产率，降解DNA和抑制PCR反应而严重影响STR检测分型。样本含有抑制物时，结果图谱特征与降解样本的检测结果类似。但造成检测失败或结果不佳的主要原因是样本中含抑制物，而DNA模板的数量和片段大小能够满足STR分型需要。对这类样本，去除抑制物后进行检测，可获得理想的分型结果。因此，对于检测失败或结果欠佳的样本，要判断主要原因是降解还是含抑制物。较好的方法是在扩增体系中引入扩增对照，在上海亲子鉴定扩增体系中加入一对扩增已知模板的引物和相应模板，如果是样本降解，扩增对照能正常扩增，若含抑制物，则扩增对照也被抑制。含抑制物的样本，增加模板体积会使扩增结果变得更糟，有时减上海亲子鉴定少扩增模板体积，使抑制物相对变少，反而可获得理想的分型结果a对明确主要影响是禽抑制物的样本，采用超滤、DNA吸附分离等方法纯化样本DNA后，可获得理想的分型结果。
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