连锁状态可以通过重组片段或者两个基因座之间的上海亲子鉴定距离加以描述。两个基因座之间距离的典型数据单位为cM，或者也可以用上海亲子鉴定表示物理距离的碱基数加以描述。在人类遗传学中，lcM被指定为等于大约】000kb（1×10'个碱基)。通过标准公式，也可以将物理距离转换为重组片段。①重组片段可能因性别而异。可以根据性别各自分别给出物理距离，或者给出两种性别的平均距离。连锁不平衡是这样一种状态，它描述了不同基因座上等位基因之间的关系。值得指出的是，连锁或者其他种群人口遗传学效应如种群再分等都可能会造成连锁不平衡。我们将在后面的章节对此加以验证。因此，预先设定下列逻辑就是不正确的。A:基因座位于不同的染色体上或者位于同一个上海亲子鉴定染色体上但被完全分离了。这个表述暗示了B：不存在连锁L因而暗示了C：不存在连锁不平衡现代基因学理论表明，从陈述A到陈述B的过渡是逻辑的，并且有实验观察结果可以作为基础。然而，没有任何附加数据支持从陈述B到陈述C的推理过程。
