后开始电泳分离。样品盘的移动通过步进电机控制，可进行精确的三维移动i电泳中，上海亲子鉴定等位基因片段在聚合物溶液中从负极向正极泳动，不同大小的片段逐渐被分离，最终以片段从小到大的顺序依次经过检测窗口，激光激发装置连续发射激光，激发等位基因片段上荧光染料的荧光．释放出不同波长的荧光，被一直在线的荧光检测装置检测其种类和强度，转换成电信号，在上海亲子鉴定计算机上形成峰图并自动记录。以310遗传分析仪为例，lvIPCR产物混入ltll分子量内标和25ptl去离子甲酰胺，机器加热板上控制温度为60℃，使紧贴于加热板上的毛细管维持同样的温度，保持电泳过程中样品DNA分子处于热变性解链状态。整个过程无需人工干预。 ．．
毛细管电泳的灌胶、进样、分离、检测、记录等全过程完全由设备自动完成，在无人操作的情况下，可对多个样本进行连续自动电泳矿荧光检测器灵敏度高，有利于法医学微量检材的成功检出。每次电泳所需的样本量很少，便于PCR产物重复电泳。采用小电流高电压电泳，大大提高了电泳分离速度，25～40分钟即可完成一次电泳分离。电泳得到的数据采用数字格式存储，便于后期分析处理和保存。
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