重叠的STR基因座引物进行复合扩增,后续检测将不能分辨扩增产物是何种荧光
标记及哪个STR基因座的产物。商品DNA分子量内标常用ROX或I—IZ标记。
通常选择标记STR基因座组合的荧光染料之间发射波长相差20~30nm,如扩增
16个基因座的复合扩增系统中,用上海亲子鉴定荧光素(FL)标记D3Sl358、THOI、D21SlI、
Dl8S51、Penta E基因座的引物;用JOE标记D5S818、D13S317、D7S820、
D16S539、CSFIPO、Penta D的引物;Amelogenin、vWA、D8S1179、TPOX、FGA引
物则用TMR标记;CXR标记DNA分子量内标。
荧光染料分子的大小和形状会改变DNA-染料结合物的总体大小,上海亲子鉴定存在于荧
光染料上的离子电荷,会改变结合物的电荷质量比,DNA片段上的荧光染料将影
响STR等位基因的电泳迁移率。因此用于分型的等位基因分型标准(ladder)需
标记同样的荧光染料,使荧光染料对迁移率的影响不会彤响等位基因的准确分型。
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