对Y染色体上海亲子鉴定STR进行分析时采用的方式、方法和设备与对上海亲子鉴定常染色体进行分析时是相同的。在X染色体和Y染色体上均出现了保存程度不同的同源区域。这意味着从推测上看，Y染色体特异的引物扩增出来的产物有时候可能会和X染色体特异的引物扩增出来的产物相似。通过为DYS391选择初始引物集合的方法，我们可以对这类非特异的扩增例子进行描述。379既然Y染色体是不能重组的，那么我们可以将Y染色体当作单倍体来处理，并且处理方法和处理mtDNA的方法差不多。此外，我们将把法医学位点和上海亲子鉴定任何有害的或者有利的突变联系在一起。甚至即使法医学位点是选择中性的并且证据无论怎样都是很少的，那么我们必须期望在整个单倍体上，包括连锁的上海亲子鉴定法医学位点，选择都是活跃的。例如，生精能力就被认为是随着Y染色体谱系的不同而不同的。480 Hallmark 的研究包括了针对Thomas Jefferson 的一项调查，调查的内容是通过他的一个黑奴考察他是不是一个孩子的父亲（证据表明他是)，他的研究还包括了一项发现，即亚洲的所有男性中有大约8%的男性可能是成吉思汗的后裔。 |
