例如，当前的上海亲子鉴定中心系统能够检测5个颜色。DNA片段长度的确定有赖于两种类型的标准标记的使用。在经过电泳处理后的每一个样本中，包括了一系列经染色标记且已知长度的DNA片段。这个内部长度标准可能由已经作了染色标记的限制性噬菌体（re-stricted bacteriophage） DNA （例如，Applied Biosystems 公司的GS 500 产品）或者上海亲子鉴定中心可选的人工DNA多联体(artificial DNA concatamer) (例如，Applied Biosystems公司的HD 400产品）构成。第二种标准标记是“等位基因阶梯”（allelic ladder) （图1.2)。等位基因阶梯由每一个基因座的所有常见等位基因组成，爻并且可以和上海亲子鉴定中心电泳试验中的每一个条带进行比较。349等位基因阶梯应该涵盖一个基因座上的所有常见等位基因。
